Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RLBP1P12271 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RLBP1P12271 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RLBP1P12271 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RLBP1P12271 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RLBP1P12271 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RLBP1P12271 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RLBP1P12271 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RLBP1P12271 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RLBP1P12271 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RLBP1P12271 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RLBP1P12271 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RLBP1P12271 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RLBP1P12271 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RLBP1P12271 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RLBP1P12271 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RLBP1P12271 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RLBP1P12271 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RLBP1P12271 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RLBP1P12271 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RLBP1P12271 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms