Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBL4AP11441 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBL4AP11441 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBL4AP11441 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4AP11441 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4AP11441 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL4AP11441 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL4AP11441 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4AP11441 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4AP11441 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms