Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTBP11277 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTBP11277 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTBP11277 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTBP11277 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTBP11277 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTBP11277 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTBP11277 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTBP11277 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTBP11277 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTBP11277 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTBP11277 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTBP11277 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTBP11277 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTBP11277 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTBP11277 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTBP11277 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTBP11277 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTBP11277 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTBP11277 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTBP11277 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTBP11277 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTBP11277 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTBP11277 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTBP11277 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTBP11277 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTBP11277 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTBP11277 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTBP11277 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTBP11277 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTBP11277 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTBP11277 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPTBP11277 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPTBP11277 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTBP11277 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTBP11277 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTBP11277 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTBP11277 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPTBP11277 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTBP11277 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTBP11277 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTBP11277 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTBP11277 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTBP11277 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTBP11277 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTBP11277 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTBP11277 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTBP11277 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTBP11277 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBP11277 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBP11277 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBP11277 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBP11277 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBP11277 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBP11277 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBP11277 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBP11277 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBP11277 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBP11277 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTBP11277 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTBP11277 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTBP11277 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTBP11277 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTBP11277 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTBP11277 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTBP11277 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTBP11277 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTBP11277 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTBP11277 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTBP11277 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTBP11277 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTBP11277 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBP11277 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBP11277 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBP11277 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBP11277 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBP11277 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTBP11277 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTBP11277 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTBP11277 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTBP11277 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTBP11277 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTBP11277 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTBP11277 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBP11277 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBP11277 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBP11277 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBP11277 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBP11277 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SPTBP11277 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTBP11277 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBP11277 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTBP11277 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTBP11277 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBP11277 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms