Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GP1BAP07359 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GP1BAP07359 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GP1BAP07359 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GP1BAP07359 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GP1BAP07359 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GP1BAP07359 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GP1BAP07359 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GP1BAP07359 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GP1BAP07359 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GP1BAP07359 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GP1BAP07359 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GP1BAP07359 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GP1BAP07359 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GP1BAP07359 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms