Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCCAP05165 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCCAP05165 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCCAP05165 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCCAP05165 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCCAP05165 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCCAP05165 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCCAP05165 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCCAP05165 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCCAP05165 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCCAP05165 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PCCAP05165 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCCAP05165 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PCCAP05165 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCCAP05165 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCCAP05165 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCCAP05165 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCCAP05165 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCCAP05165 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCCAP05165 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PCCAP05165 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCCAP05165 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCCAP05165 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCCAP05165 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCCAP05165 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCCAP05165 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PCCAP05165 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCCAP05165 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCCAP05165 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCCAP05165 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCCAP05165 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCCAP05165 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCCAP05165 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCCAP05165 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PCCAP05165 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCCAP05165 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PCCAP05165 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCCAP05165 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCCAP05165 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCCAP05165 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PCCAP05165 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCCAP05165 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCCAP05165 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCCAP05165 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PCCAP05165 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCCAP05165 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCCAP05165 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PCCAP05165 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCCAP05165 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCCAP05165 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCCAP05165 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCCAP05165 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCCAP05165 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCCAP05165 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCCAP05165 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCCAP05165 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PCCAP05165 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCCAP05165 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCCAP05165 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PCCAP05165 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
PCCAP05165 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCCAP05165 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCCAP05165 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCCAP05165 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCCAP05165 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCCAP05165 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCCAP05165 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCCAP05165 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PCCAP05165 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCCAP05165 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCCAP05165 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCCAP05165 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCCAP05165 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCCAP05165 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCCAP05165 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PCCAP05165 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCCAP05165 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCCAP05165 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCCAP05165 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCCAP05165 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCCAP05165 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCCAP05165 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCCAP05165 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCCAP05165 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCCAP05165 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCCAP05165 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCCAP05165 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PCCAP05165 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCCAP05165 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PCCAP05165 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCCAP05165 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCCAP05165 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCCAP05165 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCCAP05165 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCCAP05165 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCCAP05165 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PCCAP05165 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCCAP05165 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCCAP05165 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCCAP05165 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms