Protein–RNA interactions for Protein: P01860

IGHG3, Immunoglobulin heavy constant gamma 3, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG3P01860 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHG3P01860 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHG3P01860 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHG3P01860 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHG3P01860 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHG3P01860 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHG3P01860 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHG3P01860 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHG3P01860 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHG3P01860 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHG3P01860 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHG3P01860 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHG3P01860 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHG3P01860 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHG3P01860 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHG3P01860 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHG3P01860 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHG3P01860 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms