Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-7P01780 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-7P01780 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-7P01780 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV3-7P01780 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-7P01780 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-7P01780 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-7P01780 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms