Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NSD2O96028 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NSD2O96028 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NSD2O96028 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NSD2O96028 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD2O96028 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD2O96028 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NSD2O96028 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NSD2O96028 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NSD2O96028 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NSD2O96028 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NSD2O96028 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NSD2O96028 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NSD2O96028 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NSD2O96028 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NSD2O96028 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NSD2O96028 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NSD2O96028 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD2O96028 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD2O96028 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NSD2O96028 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NSD2O96028 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NSD2O96028 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NSD2O96028 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NSD2O96028 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NSD2O96028 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NSD2O96028 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NSD2O96028 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NSD2O96028 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NSD2O96028 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NSD2O96028 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NSD2O96028 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NSD2O96028 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NSD2O96028 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NSD2O96028 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NSD2O96028 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD2O96028 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NSD2O96028 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NSD2O96028 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD2O96028 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD2O96028 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NSD2O96028 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NSD2O96028 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NSD2O96028 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NSD2O96028 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NSD2O96028 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NSD2O96028 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NSD2O96028 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NSD2O96028 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NSD2O96028 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NSD2O96028 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NSD2O96028 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NSD2O96028 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NSD2O96028 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NSD2O96028 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NSD2O96028 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NSD2O96028 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NSD2O96028 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NSD2O96028 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms