Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NSD2O96028 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NSD2O96028 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NSD2O96028 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NSD2O96028 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD2O96028 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD2O96028 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD2O96028 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NSD2O96028 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NSD2O96028 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NSD2O96028 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NSD2O96028 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NSD2O96028 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NSD2O96028 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NSD2O96028 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NSD2O96028 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NSD2O96028 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NSD2O96028 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NSD2O96028 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD2O96028 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD2O96028 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NSD2O96028 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD2O96028 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NSD2O96028 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD2O96028 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NSD2O96028 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NSD2O96028 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD2O96028 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NSD2O96028 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NSD2O96028 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NSD2O96028 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NSD2O96028 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NSD2O96028 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NSD2O96028 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NSD2O96028 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NSD2O96028 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NSD2O96028 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NSD2O96028 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NSD2O96028 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NSD2O96028 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NSD2O96028 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NSD2O96028 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD2O96028 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD2O96028 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NSD2O96028 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NSD2O96028 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD2O96028 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD2O96028 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD2O96028 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NSD2O96028 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NSD2O96028 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NSD2O96028 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NSD2O96028 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NSD2O96028 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NSD2O96028 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NSD2O96028 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NSD2O96028 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NSD2O96028 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NSD2O96028 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NSD2O96028 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NSD2O96028 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NSD2O96028 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NSD2O96028 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NSD2O96028 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NSD2O96028 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NSD2O96028 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NSD2O96028 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NSD2O96028 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NSD2O96028 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms