Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPNE6O95741 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPNE6O95741 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPNE6O95741 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPNE6O95741 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPNE6O95741 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPNE6O95741 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPNE6O95741 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE6O95741 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPNE6O95741 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPNE6O95741 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPNE6O95741 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPNE6O95741 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms