Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPNE6O95741 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPNE6O95741 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CPNE6O95741 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPNE6O95741 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPNE6O95741 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPNE6O95741 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPNE6O95741 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CPNE6O95741 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPNE6O95741 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPNE6O95741 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPNE6O95741 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPNE6O95741 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPNE6O95741 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPNE6O95741 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPNE6O95741 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPNE6O95741 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPNE6O95741 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPNE6O95741 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPNE6O95741 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CPNE6O95741 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CPNE6O95741 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPNE6O95741 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPNE6O95741 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPNE6O95741 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPNE6O95741 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPNE6O95741 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPNE6O95741 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPNE6O95741 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPNE6O95741 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPNE6O95741 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPNE6O95741 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPNE6O95741 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPNE6O95741 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPNE6O95741 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPNE6O95741 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPNE6O95741 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPNE6O95741 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CPNE6O95741 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPNE6O95741 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPNE6O95741 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPNE6O95741 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CPNE6O95741 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPNE6O95741 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPNE6O95741 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPNE6O95741 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPNE6O95741 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPNE6O95741 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPNE6O95741 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPNE6O95741 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPNE6O95741 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPNE6O95741 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPNE6O95741 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPNE6O95741 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPNE6O95741 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPNE6O95741 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPNE6O95741 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPNE6O95741 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPNE6O95741 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CPNE6O95741 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPNE6O95741 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPNE6O95741 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPNE6O95741 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPNE6O95741 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPNE6O95741 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPNE6O95741 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPNE6O95741 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPNE6O95741 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPNE6O95741 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPNE6O95741 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPNE6O95741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPNE6O95741 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPNE6O95741 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPNE6O95741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPNE6O95741 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPNE6O95741 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPNE6O95741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPNE6O95741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPNE6O95741 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPNE6O95741 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPNE6O95741 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPNE6O95741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPNE6O95741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPNE6O95741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms