Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT4O95628 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT4O95628 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT4O95628 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT4O95628 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT4O95628 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT4O95628 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT4O95628 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT4O95628 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT4O95628 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT4O95628 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT4O95628 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT4O95628 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT4O95628 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT4O95628 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT4O95628 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT4O95628 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms