Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRPF6O94906 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRPF6O94906 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRPF6O94906 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRPF6O94906 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRPF6O94906 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRPF6O94906 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRPF6O94906 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRPF6O94906 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRPF6O94906 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRPF6O94906 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRPF6O94906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF6O94906 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF6O94906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRPF6O94906 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF6O94906 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF6O94906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF6O94906 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF6O94906 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF6O94906 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF6O94906 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPF6O94906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms