Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCATO75600 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCATO75600 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCATO75600 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCATO75600 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GCATO75600 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCATO75600 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCATO75600 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCATO75600 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCATO75600 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCATO75600 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCATO75600 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCATO75600 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCATO75600 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCATO75600 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCATO75600 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCATO75600 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCATO75600 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCATO75600 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCATO75600 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCATO75600 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCATO75600 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCATO75600 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCATO75600 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCATO75600 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCATO75600 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCATO75600 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCATO75600 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCATO75600 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCATO75600 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCATO75600 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCATO75600 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCATO75600 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCATO75600 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCATO75600 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCATO75600 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCATO75600 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCATO75600 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCATO75600 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCATO75600 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCATO75600 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCATO75600 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCATO75600 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCATO75600 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCATO75600 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCATO75600 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCATO75600 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCATO75600 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCATO75600 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCATO75600 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCATO75600 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCATO75600 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCATO75600 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCATO75600 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCATO75600 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCATO75600 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCATO75600 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCATO75600 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCATO75600 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCATO75600 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCATO75600 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GCATO75600 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCATO75600 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCATO75600 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCATO75600 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCATO75600 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCATO75600 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCATO75600 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCATO75600 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCATO75600 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCATO75600 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCATO75600 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCATO75600 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCATO75600 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCATO75600 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCATO75600 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCATO75600 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCATO75600 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCATO75600 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCATO75600 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCATO75600 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCATO75600 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCATO75600 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCATO75600 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCATO75600 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCATO75600 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCATO75600 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GCATO75600 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCATO75600 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCATO75600 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCATO75600 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCATO75600 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCATO75600 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCATO75600 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCATO75600 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCATO75600 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCATO75600 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCATO75600 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCATO75600 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCATO75600 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms