Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GCATO75600 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GCATO75600 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GCATO75600 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GCATO75600 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GCATO75600 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GCATO75600 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GCATO75600 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GCATO75600 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GCATO75600 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GCATO75600 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GCATO75600 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GCATO75600 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GCATO75600 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GCATO75600 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GCATO75600 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GCATO75600 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GCATO75600 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GCATO75600 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCATO75600 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GCATO75600 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GCATO75600 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GCATO75600 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GCATO75600 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GCATO75600 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GCATO75600 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCATO75600 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCATO75600 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GCATO75600 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GCATO75600 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GCATO75600 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GCATO75600 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GCATO75600 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GCATO75600 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GCATO75600 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GCATO75600 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCATO75600 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCATO75600 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GCATO75600 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GCATO75600 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GCATO75600 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GCATO75600 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GCATO75600 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GCATO75600 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GCATO75600 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCATO75600 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCATO75600 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCATO75600 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCATO75600 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCATO75600 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GCATO75600 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCATO75600 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCATO75600 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GCATO75600 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GCATO75600 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCATO75600 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCATO75600 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCATO75600 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCATO75600 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCATO75600 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCATO75600 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GCATO75600 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GCATO75600 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCATO75600 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GCATO75600 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GCATO75600 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCATO75600 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCATO75600 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCATO75600 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCATO75600 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCATO75600 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCATO75600 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCATO75600 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCATO75600 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GCATO75600 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCATO75600 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCATO75600 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCATO75600 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCATO75600 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GCATO75600 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCATO75600 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCATO75600 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GCATO75600 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCATO75600 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCATO75600 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GCATO75600 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCATO75600 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCATO75600 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCATO75600 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCATO75600 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCATO75600 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GCATO75600 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GCATO75600 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCATO75600 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCATO75600 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCATO75600 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCATO75600 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCATO75600 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCATO75600 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCATO75600 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms