Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF10O60809 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF10O60809 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF10O60809 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF10O60809 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF10O60809 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF10O60809 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF10O60809 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF10O60809 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRAMEF10O60809 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms