Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GREM1O60565 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GREM1O60565 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GREM1O60565 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GREM1O60565 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GREM1O60565 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GREM1O60565 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GREM1O60565 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GREM1O60565 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GREM1O60565 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GREM1O60565 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GREM1O60565 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GREM1O60565 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GREM1O60565 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GREM1O60565 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GREM1O60565 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GREM1O60565 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GREM1O60565 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREM1O60565 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREM1O60565 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GREM1O60565 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GREM1O60565 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GREM1O60565 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GREM1O60565 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GREM1O60565 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GREM1O60565 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GREM1O60565 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GREM1O60565 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GREM1O60565 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GREM1O60565 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GREM1O60565 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GREM1O60565 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GREM1O60565 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GREM1O60565 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GREM1O60565 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GREM1O60565 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GREM1O60565 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GREM1O60565 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GREM1O60565 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GREM1O60565 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GREM1O60565 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GREM1O60565 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GREM1O60565 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GREM1O60565 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GREM1O60565 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GREM1O60565 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GREM1O60565 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GREM1O60565 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GREM1O60565 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GREM1O60565 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GREM1O60565 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GREM1O60565 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GREM1O60565 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GREM1O60565 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GREM1O60565 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GREM1O60565 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GREM1O60565 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GREM1O60565 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GREM1O60565 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GREM1O60565 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GREM1O60565 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GREM1O60565 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GREM1O60565 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GREM1O60565 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GREM1O60565 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GREM1O60565 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREM1O60565 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREM1O60565 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREM1O60565 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREM1O60565 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREM1O60565 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREM1O60565 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GREM1O60565 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GREM1O60565 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GREM1O60565 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GREM1O60565 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GREM1O60565 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREM1O60565 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREM1O60565 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREM1O60565 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GREM1O60565 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GREM1O60565 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GREM1O60565 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GREM1O60565 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREM1O60565 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREM1O60565 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GREM1O60565 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREM1O60565 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GREM1O60565 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GREM1O60565 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GREM1O60565 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREM1O60565 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREM1O60565 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREM1O60565 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GREM1O60565 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GREM1O60565 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREM1O60565 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREM1O60565 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREM1O60565 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREM1O60565 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms