Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP8B3O60423 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP8B3O60423 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP8B3O60423 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP8B3O60423 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP8B3O60423 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP8B3O60423 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP8B3O60423 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP8B3O60423 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP8B3O60423 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP8B3O60423 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms