Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD3O43242 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD3O43242 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSMD3O43242 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMD3O43242 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD3O43242 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD3O43242 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD3O43242 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD3O43242 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD3O43242 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD3O43242 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD3O43242 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD3O43242 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD3O43242 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD3O43242 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD3O43242 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD3O43242 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms