Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD3EAPO15446 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD3EAPO15446 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD3EAPO15446 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD3EAPO15446 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD3EAPO15446 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD3EAPO15446 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD3EAPO15446 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD3EAPO15446 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CD3EAPO15446 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD3EAPO15446 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CD3EAPO15446 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD3EAPO15446 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CD3EAPO15446 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CD3EAPO15446 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CD3EAPO15446 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD3EAPO15446 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD3EAPO15446 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD3EAPO15446 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD3EAPO15446 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD3EAPO15446 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD3EAPO15446 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD3EAPO15446 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD3EAPO15446 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD3EAPO15446 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD3EAPO15446 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD3EAPO15446 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD3EAPO15446 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms