Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DCLK1O15075 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DCLK1O15075 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DCLK1O15075 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DCLK1O15075 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DCLK1O15075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK1O15075 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCLK1O15075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DCLK1O15075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCLK1O15075 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DCLK1O15075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCLK1O15075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DCLK1O15075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DCLK1O15075 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DCLK1O15075 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DCLK1O15075 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms