Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AURKAO14965 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AURKAO14965 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AURKAO14965 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AURKAO14965 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AURKAO14965 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AURKAO14965 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AURKAO14965 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AURKAO14965 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AURKAO14965 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AURKAO14965 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AURKAO14965 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AURKAO14965 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AURKAO14965 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AURKAO14965 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AURKAO14965 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AURKAO14965 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AURKAO14965 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AURKAO14965 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AURKAO14965 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AURKAO14965 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AURKAO14965 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AURKAO14965 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AURKAO14965 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AURKAO14965 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AURKAO14965 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AURKAO14965 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AURKAO14965 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AURKAO14965 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AURKAO14965 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AURKAO14965 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AURKAO14965 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AURKAO14965 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AURKAO14965 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AURKAO14965 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AURKAO14965 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AURKAO14965 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AURKAO14965 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AURKAO14965 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AURKAO14965 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AURKAO14965 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AURKAO14965 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AURKAO14965 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AURKAO14965 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AURKAO14965 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AURKAO14965 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AURKAO14965 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AURKAO14965 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AURKAO14965 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AURKAO14965 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AURKAO14965 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AURKAO14965 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AURKAO14965 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AURKAO14965 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AURKAO14965 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AURKAO14965 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AURKAO14965 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AURKAO14965 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AURKAO14965 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AURKAO14965 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AURKAO14965 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AURKAO14965 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AURKAO14965 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AURKAO14965 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AURKAO14965 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AURKAO14965 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AURKAO14965 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AURKAO14965 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AURKAO14965 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AURKAO14965 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AURKAO14965 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AURKAO14965 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AURKAO14965 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AURKAO14965 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AURKAO14965 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AURKAO14965 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AURKAO14965 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AURKAO14965 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AURKAO14965 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AURKAO14965 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AURKAO14965 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AURKAO14965 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AURKAO14965 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AURKAO14965 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AURKAO14965 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AURKAO14965 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AURKAO14965 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AURKAO14965 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AURKAO14965 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AURKAO14965 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AURKAO14965 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AURKAO14965 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AURKAO14965 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AURKAO14965 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AURKAO14965 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AURKAO14965 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AURKAO14965 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AURKAO14965 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AURKAO14965 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AURKAO14965 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms