Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GFRA2O00451 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GFRA2O00451 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GFRA2O00451 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GFRA2O00451 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA2O00451 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GFRA2O00451 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GFRA2O00451 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GFRA2O00451 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GFRA2O00451 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GFRA2O00451 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GFRA2O00451 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GFRA2O00451 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GFRA2O00451 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GFRA2O00451 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFRA2O00451 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GFRA2O00451 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA2O00451 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms