Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QLI3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLI3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLI3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLI3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLI3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QLI3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLI3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QLI3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3QLI3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QLI3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QLI3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QLI3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QLI3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLI3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLI3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QLI3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLI3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLI3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QLI3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLI3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLI3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLI3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QLI3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLI3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QLI3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLI3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QLI3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QLI3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QLI3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QLI3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QLI3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QLI3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLI3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLI3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLI3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLI3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QLI3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLI3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLI3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLI3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLI3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QLI3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLI3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLI3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLI3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLI3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QLI3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLI3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLI3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLI3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLI3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QLI3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QLI3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QLI3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLI3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLI3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLI3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLI3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLI3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QLI3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLI3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLI3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLI3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QLI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QLI3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QLI3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QLI3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLI3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLI3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QLI3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QLI3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLI3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLI3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLI3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QLI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLI3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QLI3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QLI3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QLI3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QLI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QLI3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3QLI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QLI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QLI3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLI3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QLI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QLI3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QLI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QLI3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms