Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BQ06 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BQ06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H3BQ06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H3BQ06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
H3BQ06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H3BQ06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQ06 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H3BQ06 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
H3BQ06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
H3BQ06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
H3BQ06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
H3BQ06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
H3BQ06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H3BQ06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
H3BQ06 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H3BQ06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
H3BQ06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQ06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQ06 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H3BQ06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQ06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BQ06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQ06 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H3BQ06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H3BQ06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
H3BQ06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
H3BQ06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H3BQ06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H3BQ06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BQ06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BQ06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
H3BQ06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQ06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQ06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQ06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQ06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H3BQ06 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H3BQ06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
H3BQ06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
H3BQ06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H3BQ06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H3BQ06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H3BQ06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQ06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQ06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
H3BQ06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQ06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQ06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H3BQ06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H3BQ06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H3BQ06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BQ06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BQ06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BQ06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H3BQ06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQ06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BQ06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQ06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQ06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQ06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BQ06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H3BQ06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H3BQ06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQ06 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQ06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BQ06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQ06 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQ06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQ06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
H3BQ06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
H3BQ06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BQ06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQ06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQ06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H3BQ06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H3BQ06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
H3BQ06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H3BQ06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H3BQ06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BQ06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BQ06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H3BQ06 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H3BQ06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BQ06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H3BQ06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQ06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQ06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQ06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQ06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms