Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
E5RI56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
E5RI56 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E5RI56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E5RI56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E5RI56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E5RI56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E5RI56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E5RI56 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E5RI56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E5RI56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E5RI56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E5RI56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E5RI56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
E5RI56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
E5RI56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E5RI56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E5RI56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E5RI56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E5RI56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E5RI56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
E5RI56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E5RI56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E5RI56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E5RI56 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E5RI56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E5RI56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E5RI56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E5RI56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E5RI56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E5RI56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E5RI56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E5RI56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E5RI56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E5RI56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E5RI56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E5RI56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E5RI56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E5RI56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E5RI56 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E5RI56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E5RI56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E5RI56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E5RI56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E5RI56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E5RI56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E5RI56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E5RI56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E5RI56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E5RI56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E5RI56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
E5RI56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E5RI56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E5RI56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E5RI56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E5RI56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E5RI56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E5RI56 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E5RI56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E5RI56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E5RI56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E5RI56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
E5RI56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E5RI56 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E5RI56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E5RI56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E5RI56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E5RI56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E5RI56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E5RI56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E5RI56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E5RI56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E5RI56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E5RI56 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E5RI56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E5RI56 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E5RI56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E5RI56 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E5RI56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E5RI56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E5RI56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E5RI56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E5RI56 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E5RI56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E5RI56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E5RI56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E5RI56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E5RI56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E5RI56 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E5RI56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E5RI56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E5RI56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E5RI56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E5RI56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E5RI56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E5RI56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E5RI56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E5RI56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E5RI56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E5RI56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms