Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA8AA7E2F4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GOLGA8AA7E2F4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GOLGA8AA7E2F4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA8AA7E2F4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA8AA7E2F4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA8AA7E2F4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA8AA7E2F4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA8AA7E2F4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA8AA7E2F4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA8AA7E2F4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GOLGA8AA7E2F4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA8AA7E2F4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA8AA7E2F4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA8AA7E2F4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA8AA7E2F4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GOLGA8AA7E2F4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GOLGA8AA7E2F4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA8AA7E2F4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA8AA7E2F4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA8AA7E2F4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA8AA7E2F4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA8AA7E2F4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA8AA7E2F4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA8AA7E2F4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GOLGA8AA7E2F4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GOLGA8AA7E2F4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GOLGA8AA7E2F4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GOLGA8AA7E2F4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GOLGA8AA7E2F4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA8AA7E2F4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA8AA7E2F4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms