Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCAF2A6NFQ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCAF2A6NFQ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCAF2A6NFQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCAF2A6NFQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCAF2A6NFQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCAF2A6NFQ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCAF2A6NFQ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCAF2A6NFQ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCAF2A6NFQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCAF2A6NFQ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCAF2A6NFQ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCAF2A6NFQ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms