Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP1P13796 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP1P13796 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP1P13796 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP1P13796 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP1P13796 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCP1P13796 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCP1P13796 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCP1P13796 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCP1P13796 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCP1P13796 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCP1P13796 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCP1P13796 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCP1P13796 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCP1P13796 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCP1P13796 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCP1P13796 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCP1P13796 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCP1P13796 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCP1P13796 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCP1P13796 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCP1P13796 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCP1P13796 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCP1P13796 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCP1P13796 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCP1P13796 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms