Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LCP1P13796 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LCP1P13796 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LCP1P13796 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LCP1P13796 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LCP1P13796 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LCP1P13796 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LCP1P13796 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LCP1P13796 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LCP1P13796 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LCP1P13796 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LCP1P13796 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LCP1P13796 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LCP1P13796 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LCP1P13796 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LCP1P13796 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LCP1P13796 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LCP1P13796 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LCP1P13796 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LCP1P13796 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LCP1P13796 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LCP1P13796 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LCP1P13796 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LCP1P13796 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LCP1P13796 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LCP1P13796 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LCP1P13796 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LCP1P13796 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LCP1P13796 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LCP1P13796 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LCP1P13796 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LCP1P13796 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LCP1P13796 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LCP1P13796 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LCP1P13796 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LCP1P13796 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LCP1P13796 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LCP1P13796 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LCP1P13796 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LCP1P13796 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LCP1P13796 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LCP1P13796 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LCP1P13796 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LCP1P13796 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LCP1P13796 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LCP1P13796 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LCP1P13796 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LCP1P13796 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LCP1P13796 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LCP1P13796 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LCP1P13796 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LCP1P13796 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
LCP1P13796 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LCP1P13796 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LCP1P13796 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LCP1P13796 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LCP1P13796 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LCP1P13796 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LCP1P13796 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LCP1P13796 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LCP1P13796 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LCP1P13796 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LCP1P13796 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LCP1P13796 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LCP1P13796 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LCP1P13796 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LCP1P13796 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LCP1P13796 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LCP1P13796 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LCP1P13796 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LCP1P13796 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LCP1P13796 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LCP1P13796 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LCP1P13796 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LCP1P13796 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LCP1P13796 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LCP1P13796 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LCP1P13796 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LCP1P13796 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LCP1P13796 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LCP1P13796 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LCP1P13796 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LCP1P13796 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LCP1P13796 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LCP1P13796 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LCP1P13796 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LCP1P13796 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LCP1P13796 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LCP1P13796 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LCP1P13796 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LCP1P13796 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LCP1P13796 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LCP1P13796 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LCP1P13796 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LCP1P13796 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LCP1P13796 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LCP1P13796 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LCP1P13796 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LCP1P13796 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LCP1P13796 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms