Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 420.42■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.844e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.764e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-204ENST00000577712 429 ntTSL 519.12■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 518.73■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 217.77■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 217.45■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 516.78■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 CHTF18-212ENST00000493715 691 ntTSL 316.7■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 415.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 314.31□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-213ENST00000482600 1294 ntTSL 511.4□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-212ENST00000477256 1708 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 58.32□□□□□ -1.082e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 57.93□□□□□ -1.144e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 44.2□□□□□ -1.742e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-211ENST00000530321 339 ntTSL 23.89□□□□□ -1.792e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 TIMM23B-204ENST00000483296 1156 ntTSL 220.22■□□□□ 0.833e-9■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-9■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.073e-9■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 TIMM23B-203ENST00000478381 2623 ntTSL 213.45□□□□□ -0.263e-9■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.18□□□□□ -1.583e-9■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 324.3■■□□□ 1.485e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.15e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 219.73■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 315.97■□□□□ 0.155e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 315.37■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 PTBP1-213ENST00000587191 357 ntTSL 514.01□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 20.4
AATFQ9NY61 UBAP2-209ENST00000474372 1339 ntTSL 516.95■□□□□ 0.38e-74■■■■□ 20.3
AATFQ9NY61 UBAP2-211ENST00000488443 492 ntTSL 516.37■□□□□ 0.218e-74■■■■□ 20.3
AATFQ9NY61 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.568e-74■■■■□ 20.3
AATFQ9NY61 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.948e-74■■■■□ 20.3
AATFQ9NY61 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 217.9■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 20.2
AATFQ9NY61 RB1CC1-206ENST00000518710 711 ntTSL 331.09■■■□□ 2.572e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.421e-6■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.061e-6■■■■□ 20.1
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AATFQ9NY61 GADD45A-203ENST00000460575 874 ntTSL 227.64■■■□□ 2.021e-6■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.81e-6■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.712e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 324.29■■□□□ 1.482e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 RB1CC1-204ENST00000518211 891 ntTSL 522.2■■□□□ 1.142e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 321.91■■□□□ 1.12e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 RB1CC1-203ENST00000517963 551 ntTSL 421.85■■□□□ 1.092e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.842e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.582e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 SLC43A1-203ENST00000525764 556 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 27.81□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-211ENST00000452474 518 ntTSL 47.81□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 RB1CC1-205ENST00000518468 507 ntTSL 34.03□□□□□ -1.762e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 42.76□□□□□ -1.972e-8■■■■□ 20.1
AATFQ9NY61 PPAN-206ENST00000466025 523 ntTSL 221.95■■□□□ 1.18e-10■■■■□ 20
AATFQ9NY61 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.718e-10■■■■□ 20
AATFQ9NY61 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-7■■■■□ 20
AATFQ9NY61 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 20
AATFQ9NY61 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.226e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.786e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.366e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 515.88■□□□□ 0.136e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-213ENST00000622120 355 ntTSL 515.22■□□□□ 0.036e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.016e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.016e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.236e-8■■■■□ 19.9
AATFQ9NY61 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.256e-8■■■■□ 19.9
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