RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374098.6

TIMM23B-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TIMM23B, Length 1,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23B-201ENST00000374098 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
TIMM23B-201ENST00000374098 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.22■■■□□ 2.43
TIMM23B-201ENST00000374098 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.5■■■□□ 2.31
TIMM23B-201ENST00000374098 ABCC9O60706 1549 aa27.38■■□□□ 1.97
TIMM23B-201ENST00000374098 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.37■■□□□ 1.97
TIMM23B-201ENST00000374098 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TIMM23B-201ENST00000374098 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM23B-201ENST00000374098 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TIMM23B-201ENST00000374098 NACADO15069 1562 aa25.9■■□□□ 1.74
TIMM23B-201ENST00000374098 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.77■■□□□ 1.72
TIMM23B-201ENST00000374098 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM23B-201ENST00000374098 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.45■■□□□ 1.66
TIMM23B-201ENST00000374098 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM23B-201ENST00000374098 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
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TIMM23B-201ENST00000374098 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM23B-201ENST00000374098 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM23B-201ENST00000374098 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TIMM23B-201ENST00000374098 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.8■■□□□ 1.56
TIMM23B-201ENST00000374098 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.77■■□□□ 1.56
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TIMM23B-201ENST00000374098 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TIMM23B-201ENST00000374098 FOXD1Q16676 465 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM23B-201ENST00000374098 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.02■■□□□ 1.44
TIMM23B-201ENST00000374098 CUX2O14529 1486 aa23.89■■□□□ 1.42
TIMM23B-201ENST00000374098 NCAPD3P42695 1498 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM23B-201ENST00000374098 ERCC6Q03468 1493 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM23B-201ENST00000374098 HMGXB3Q12766 1538 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM23B-201ENST00000374098 SMARCA2P51531 1590 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM23B-201ENST00000374098 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.7■■□□□ 1.38
TIMM23B-201ENST00000374098 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMM23B-201ENST00000374098 SMARCA4P51532 1647 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM23B-201ENST00000374098 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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TIMM23B-201ENST00000374098 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM23B-201ENST00000374098 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM23B-201ENST00000374098 NESP48681 1621 aa23.42■■□□□ 1.34
TIMM23B-201ENST00000374098 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TIMM23B-201ENST00000374098 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM23B-201ENST00000374098 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM23B-201ENST00000374098 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM23B-201ENST00000374098 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMM23B-201ENST00000374098 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM23B-201ENST00000374098 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
TIMM23B-201ENST00000374098 ADRA2BP18089 450 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMM23B-201ENST00000374098 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TIMM23B-201ENST00000374098 WDR62O43379 1518 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMM23B-201ENST00000374098 MSH5O43196 834 aa22.94■■□□□ 1.26
TIMM23B-201ENST00000374098 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM23B-201ENST00000374098 WIZO95785 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM23B-201ENST00000374098 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMM23B-201ENST00000374098 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMM23B-201ENST00000374098 TRIM41Q8WV44 630 aa22.77■■□□□ 1.24
TIMM23B-201ENST00000374098 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TIMM23B-201ENST00000374098 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TIMM23B-201ENST00000374098 OSCARQ8IYS5 282 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM23B-201ENST00000374098 PRDM2Q13029 1718 aa22.64■■□□□ 1.21
TIMM23B-201ENST00000374098 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TIMM23B-201ENST00000374098 IFT140Q96RY7 1462 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM23B-201ENST00000374098 ABCC8Q09428 1581 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM23B-201ENST00000374098 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 TOPBP1Q92547 1522 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TIMM23B-201ENST00000374098 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TIMM23B-201ENST00000374098 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM23B-201ENST00000374098 ARHGEF11O15085 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM23B-201ENST00000374098 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM23B-201ENST00000374098 CHD1O14646 1710 aa22.17■■□□□ 1.14
TIMM23B-201ENST00000374098 POTEDQ86YR6 584 aa22.15■■□□□ 1.14
TIMM23B-201ENST00000374098 WDR97A6NE52 1622 aa22.13■■□□□ 1.13
TIMM23B-201ENST00000374098 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TIMM23B-201ENST00000374098 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.132e-6■■■□□ 15.4
TIMM23B-201ENST00000374098 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM23B-201ENST00000374098 ARAP1Q96P48 1450 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM23B-201ENST00000374098 FBLN2P98095 1184 aa21.99■■□□□ 1.11
TIMM23B-201ENST00000374098 SOGA1O94964 1423 aa21.98■■□□□ 1.11
TIMM23B-201ENST00000374098 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TIMM23B-201ENST00000374098 SYNJ1O43426 1573 aa21.95■■□□□ 1.11
TIMM23B-201ENST00000374098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.94■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.93■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.93■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.92■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TIMM23B-201ENST00000374098 GRIN2BQ13224 1484 aa21.89■■□□□ 1.09
TIMM23B-201ENST00000374098 SYNJ2O15056 1496 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM23B-201ENST00000374098 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM23B-201ENST00000374098 CUX1P39880 1505 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM23B-201ENST00000374098 PBRM1Q86U86 1689 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM23B-201ENST00000374098 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.75■■□□□ 1.07
TIMM23B-201ENST00000374098 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM23B-201ENST00000374098 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.7■■□□□ 1.06
TIMM23B-201ENST00000374098 GRIN2AQ12879 1464 aa21.59■■□□□ 1.05
TIMM23B-201ENST00000374098 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
TIMM23B-201ENST00000374098 ADAMTS12P58397 1594 aa21.56■■□□□ 1.04
TIMM23B-201ENST00000374098 NUP160Q12769 1436 aa21.54■■□□□ 1.04
TIMM23B-201ENST00000374098 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.52■■□□□ 1.04
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