Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFNP31947 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFNP31947 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms