RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446423.1

SDCBP2-AS1-201, SDCBP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SDCBP2-AS1, Length 1,811 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.46■■■□□ 2.63
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.31■■□□□ 1.8
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.96■■□□□ 1.75
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.71■■□□□ 1.71
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.33■■□□□ 1.65
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ABCC9O60706 1549 aa25.12■■□□□ 1.61
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SCRIBQ14160 1630 aa25.11■■□□□ 1.61
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 NACADO15069 1562 aa25■■□□□ 1.59
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.89■■□□□ 1.58
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.44■■□□□ 1.5
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.39■■□□□ 1.49
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 WIZO95785 1651 aa24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SMARCA4P51532 1647 aa24.08■■□□□ 1.44
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24■■□□□ 1.43
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TRIM41Q8WV44 630 aa23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SMARCA2P51531 1590 aa23.8■■□□□ 1.4
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.72■■□□□ 1.39
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.7■■□□□ 1.38
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 HRCP23327 699 aa23.66■■□□□ 1.38
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ABCC8Q09428 1581 aa23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 EEA1Q15075 1411 aa23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SOGA1O94964 1423 aa23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 SYNJ1O43426 1573 aa23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 HMGXB3Q12766 1538 aa23.14■■□□□ 1.3
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CEP162Q5TB80 1403 aa23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 NCAPD3P42695 1498 aa23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 GOLGA3Q08378 1498 aa23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 KIF21BO75037 1637 aa23■■□□□ 1.27
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TOP2BQ02880 1626 aa22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PRDM2Q13029 1718 aa22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CUX1P39880 1505 aa22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CLIP1P30622 1438 aa22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PRXQ9BXM0 1461 aa22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 KIF27Q86VH2 1401 aa22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ARAP1Q96P48 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CUX2O14529 1486 aa22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 APLP2Q06481 763 aa22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 IGF1RP08069 1367 aa22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TOPBP1Q92547 1522 aa22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 WDR97A6NE52 1622 aa22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CUL7Q14999 1698 aa22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 MAP3K1Q13233 1512 aa22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 TIAM1Q13009 1591 aa22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.94■■□□□ 1.1
SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms