Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SFNP31947 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SFNP31947 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SFNP31947 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SFNP31947 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SFNP31947 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SFNP31947 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SFNP31947 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SFNP31947 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SFNP31947 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SFNP31947 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SFNP31947 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SFNP31947 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SFNP31947 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SFNP31947 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SFNP31947 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SFNP31947 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SFNP31947 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SFNP31947 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SFNP31947 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SFNP31947 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SFNP31947 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SFNP31947 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SFNP31947 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SFNP31947 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SFNP31947 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SFNP31947 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SFNP31947 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SFNP31947 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SFNP31947 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SFNP31947 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SFNP31947 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SFNP31947 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SFNP31947 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SFNP31947 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SFNP31947 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SFNP31947 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SFNP31947 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SFNP31947 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SFNP31947 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SFNP31947 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SFNP31947 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SFNP31947 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SFNP31947 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SFNP31947 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SFNP31947 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SFNP31947 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SFNP31947 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SFNP31947 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SFNP31947 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SFNP31947 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SFNP31947 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SFNP31947 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SFNP31947 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SFNP31947 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SFNP31947 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SFNP31947 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SFNP31947 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SFNP31947 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SFNP31947 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SFNP31947 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SFNP31947 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SFNP31947 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SFNP31947 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SFNP31947 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SFNP31947 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SFNP31947 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SFNP31947 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SFNP31947 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SFNP31947 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SFNP31947 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SFNP31947 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SFNP31947 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SFNP31947 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SFNP31947 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SFNP31947 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SFNP31947 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SFNP31947 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SFNP31947 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SFNP31947 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SFNP31947 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SFNP31947 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SFNP31947 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SFNP31947 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SFNP31947 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SFNP31947 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SFNP31947 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SFNP31947 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SFNP31947 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SFNP31947 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SFNP31947 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SFNP31947 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SFNP31947 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SFNP31947 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SFNP31947 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SFNP31947 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SFNP31947 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SFNP31947 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SFNP31947 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SFNP31947 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms