Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms