RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640504.1

AP002851.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AP002851.1, Length 2,130 nt, Biotype bidirectional promoter lncRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002851.1-201ENST00000640504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.11■■■□□ 2.57
AP002851.1-201ENST00000640504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
AP002851.1-201ENST00000640504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
AP002851.1-201ENST00000640504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.1■■□□□ 1.77
AP002851.1-201ENST00000640504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.63■■□□□ 1.69
AP002851.1-201ENST00000640504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.61■■□□□ 1.69
AP002851.1-201ENST00000640504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
AP002851.1-201ENST00000640504 MYO15BQ96JP2 1530 aa25■■□□□ 1.59
AP002851.1-201ENST00000640504 SCRIBQ14160 1630 aa24.84■■□□□ 1.57
AP002851.1-201ENST00000640504 ABCC9O60706 1549 aa24.79■■□□□ 1.56
AP002851.1-201ENST00000640504 NACADO15069 1562 aa24.71■■□□□ 1.55
AP002851.1-201ENST00000640504 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.65■■□□□ 1.54
AP002851.1-201ENST00000640504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AP002851.1-201ENST00000640504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.36■■□□□ 1.49
AP002851.1-201ENST00000640504 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.21■■□□□ 1.47
AP002851.1-201ENST00000640504 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.13■■□□□ 1.45
AP002851.1-201ENST00000640504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.01■■□□□ 1.43
AP002851.1-201ENST00000640504 WIZO95785 1651 aa24■■□□□ 1.43
AP002851.1-201ENST00000640504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
AP002851.1-201ENST00000640504 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.83■■□□□ 1.41
AP002851.1-201ENST00000640504 SMARCA4P51532 1647 aa23.78■■□□□ 1.4
AP002851.1-201ENST00000640504 TRIM41Q8WV44 630 aa23.77■■□□□ 1.4
AP002851.1-201ENST00000640504 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.69■■□□□ 1.38
AP002851.1-201ENST00000640504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
AP002851.1-201ENST00000640504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AP002851.1-201ENST00000640504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
AP002851.1-201ENST00000640504 SMARCA2P51531 1590 aa23.51■■□□□ 1.35
AP002851.1-201ENST00000640504 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.5■■□□□ 1.35
AP002851.1-201ENST00000640504 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.49■■□□□ 1.35
AP002851.1-201ENST00000640504 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
AP002851.1-201ENST00000640504 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.38■■□□□ 1.33
AP002851.1-201ENST00000640504 HRCP23327 699 aa23.36■■□□□ 1.33
AP002851.1-201ENST00000640504 ABCC8Q09428 1581 aa23.31■■□□□ 1.32
AP002851.1-201ENST00000640504 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.22■■□□□ 1.31
AP002851.1-201ENST00000640504 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
AP002851.1-201ENST00000640504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.2■■□□□ 1.3
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AP002851.1-201ENST00000640504 SOGA1O94964 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
AP002851.1-201ENST00000640504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
AP002851.1-201ENST00000640504 EEA1Q15075 1411 aa22.94■■□□□ 1.26
AP002851.1-201ENST00000640504 SYNJ1O43426 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
AP002851.1-201ENST00000640504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.9■■□□□ 1.26
AP002851.1-201ENST00000640504 HMGXB3Q12766 1538 aa22.85■■□□□ 1.25
AP002851.1-201ENST00000640504 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AP002851.1-201ENST00000640504 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.84■■□□□ 1.25
AP002851.1-201ENST00000640504 NCAPD3P42695 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
AP002851.1-201ENST00000640504 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.79■■□□□ 1.24
AP002851.1-201ENST00000640504 CEP162Q5TB80 1403 aa22.78■■□□□ 1.24
AP002851.1-201ENST00000640504 GOLGA3Q08378 1498 aa22.74■■□□□ 1.23
AP002851.1-201ENST00000640504 TOP2BQ02880 1626 aa22.69■■□□□ 1.22
AP002851.1-201ENST00000640504 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
AP002851.1-201ENST00000640504 KIF21BO75037 1637 aa22.67■■□□□ 1.22
AP002851.1-201ENST00000640504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.65■■□□□ 1.22
AP002851.1-201ENST00000640504 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.64■■□□□ 1.22
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AP002851.1-201ENST00000640504 CFTRP13569 1480 aa22.55■■□□□ 1.2
AP002851.1-201ENST00000640504 CUX1P39880 1505 aa22.5■■□□□ 1.19
AP002851.1-201ENST00000640504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
AP002851.1-201ENST00000640504 PRDM2Q13029 1718 aa22.47■■□□□ 1.19
AP002851.1-201ENST00000640504 CLIP1P30622 1438 aa22.42■■□□□ 1.18
AP002851.1-201ENST00000640504 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
AP002851.1-201ENST00000640504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.4■■□□□ 1.18
AP002851.1-201ENST00000640504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.36■■□□□ 1.17
AP002851.1-201ENST00000640504 PRXQ9BXM0 1461 aa22.35■■□□□ 1.17
AP002851.1-201ENST00000640504 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.33■■□□□ 1.16
AP002851.1-201ENST00000640504 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.32■■□□□ 1.16
AP002851.1-201ENST00000640504 KIF27Q86VH2 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
AP002851.1-201ENST00000640504 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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AP002851.1-201ENST00000640504 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
AP002851.1-201ENST00000640504 ARAP1Q96P48 1450 aa22.14■■□□□ 1.13
AP002851.1-201ENST00000640504 CUX2O14529 1486 aa22.14■■□□□ 1.13
AP002851.1-201ENST00000640504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.14■■□□□ 1.13
AP002851.1-201ENST00000640504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.12■■□□□ 1.13
AP002851.1-201ENST00000640504 APLP2Q06481 763 aa22.11■■□□□ 1.13
AP002851.1-201ENST00000640504 IGF1RP08069 1367 aa22.06■■□□□ 1.12
AP002851.1-201ENST00000640504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.02■■□□□ 1.12
AP002851.1-201ENST00000640504 NESP48681 1621 aa22.02■■□□□ 1.12
AP002851.1-201ENST00000640504 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.99■■□□□ 1.11
AP002851.1-201ENST00000640504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.96■■□□□ 1.11
AP002851.1-201ENST00000640504 TOPBP1Q92547 1522 aa21.96■■□□□ 1.11
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AP002851.1-201ENST00000640504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.93■■□□□ 1.1
AP002851.1-201ENST00000640504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
AP002851.1-201ENST00000640504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.91■■□□□ 1.1
AP002851.1-201ENST00000640504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.91■■□□□ 1.1
AP002851.1-201ENST00000640504 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
AP002851.1-201ENST00000640504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
AP002851.1-201ENST00000640504 WDR97A6NE52 1622 aa21.8■■□□□ 1.08
AP002851.1-201ENST00000640504 CUL7Q14999 1698 aa21.78■■□□□ 1.08
AP002851.1-201ENST00000640504 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.76■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.74■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 TIAM1Q13009 1591 aa21.73■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 MAP3K1Q13233 1512 aa21.72■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.72■■□□□ 1.07
AP002851.1-201ENST00000640504 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.69■■□□□ 1.06
AP002851.1-201ENST00000640504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.69■■□□□ 1.06
AP002851.1-201ENST00000640504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.67■■□□□ 1.06
AP002851.1-201ENST00000640504 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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