Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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