RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.61■■■■□ 3.29
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CMTM3-215ENST00000568477 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM3-215ENST00000568477 NACADO15069 1562 aa30■■■□□ 2.39
CMTM3-215ENST00000568477 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.91■■■□□ 2.38
CMTM3-215ENST00000568477 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.71■■■□□ 2.35
CMTM3-215ENST00000568477 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CMTM3-215ENST00000568477 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.45■■■□□ 2.3
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CMTM3-215ENST00000568477 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
CMTM3-215ENST00000568477 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.2■■■□□ 2.26
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.18■■■□□ 2.26
CMTM3-215ENST00000568477 SCRIBQ14160 1630 aa29.01■■■□□ 2.23
CMTM3-215ENST00000568477 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.91■■■□□ 2.22
CMTM3-215ENST00000568477 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CMTM3-215ENST00000568477 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.43■■■□□ 2.14
CMTM3-215ENST00000568477 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.33■■■□□ 2.13
CMTM3-215ENST00000568477 SMARCA4P51532 1647 aa27.7■■■□□ 2.03
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CMTM3-215ENST00000568477 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
CMTM3-215ENST00000568477 SMARCA2P51531 1590 aa27.61■■■□□ 2.01
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CMTM3-215ENST00000568477 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-215ENST00000568477 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-215ENST00000568477 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
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CMTM3-215ENST00000568477 WIZO95785 1651 aa27.11■■□□□ 1.93
CMTM3-215ENST00000568477 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.01■■□□□ 1.91
CMTM3-215ENST00000568477 CUX2O14529 1486 aa27■■□□□ 1.91
CMTM3-215ENST00000568477 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
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CMTM3-215ENST00000568477 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.86■■□□□ 1.89
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CMTM3-215ENST00000568477 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CMTM3-215ENST00000568477 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.77■■□□□ 1.88
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CMTM3-215ENST00000568477 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM3-215ENST00000568477 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.57■■□□□ 1.84
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.57■■□□□ 1.84
CMTM3-215ENST00000568477 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.56■■□□□ 1.84
CMTM3-215ENST00000568477 WDR62O43379 1518 aa26.51■■□□□ 1.83
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.5■■□□□ 1.83
CMTM3-215ENST00000568477 PRDM2Q13029 1718 aa26.37■■□□□ 1.81
CMTM3-215ENST00000568477 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CMTM3-215ENST00000568477 TOPBP1Q92547 1522 aa26.09■■□□□ 1.77
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC8Q09428 1581 aa26.07■■□□□ 1.76
CMTM3-215ENST00000568477 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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CMTM3-215ENST00000568477 IFT140Q96RY7 1462 aa26.03■■□□□ 1.76
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CMTM3-215ENST00000568477 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CMTM3-215ENST00000568477 OSCARQ8IYS5 282 aa25.82■■□□□ 1.72
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CMTM3-215ENST00000568477 SOGA1O94964 1423 aa25.74■■□□□ 1.71
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CMTM3-215ENST00000568477 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.73■■□□□ 1.71
CMTM3-215ENST00000568477 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CMTM3-215ENST00000568477 WDR97A6NE52 1622 aa25.61■■□□□ 1.69
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM41Q8WV44 630 aa25.56■■□□□ 1.68
CMTM3-215ENST00000568477 CHD1O14646 1710 aa25.53■■□□□ 1.68
CMTM3-215ENST00000568477 FBLN2P98095 1184 aa25.52■■□□□ 1.68
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CMTM3-215ENST00000568477 GRIN2BQ13224 1484 aa25.49■■□□□ 1.67
CMTM3-215ENST00000568477 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
CMTM3-215ENST00000568477 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.47■■□□□ 1.67
CMTM3-215ENST00000568477 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CMTM3-215ENST00000568477 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.44■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.43■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 SYNJ1O43426 1573 aa25.42■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGEF11O15085 1522 aa25.4■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.39■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CMTM3-215ENST00000568477 PBRM1Q86U86 1689 aa25.38■■□□□ 1.65
CMTM3-215ENST00000568477 SYNJ2O15056 1496 aa25.36■■□□□ 1.65
CMTM3-215ENST00000568477 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.27■■□□□ 1.64
CMTM3-215ENST00000568477 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-215ENST00000568477 ADAMTS12P58397 1594 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-215ENST00000568477 ARAP1Q96P48 1450 aa25.17■■□□□ 1.62
CMTM3-215ENST00000568477 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
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CMTM3-215ENST00000568477 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-215ENST00000568477 NUP160Q12769 1436 aa25.05■■□□□ 1.6
CMTM3-215ENST00000568477 CEP170Q5SW79 1584 aa25.03■■□□□ 1.6
CMTM3-215ENST00000568477 KIF27Q86VH2 1401 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM3-215ENST00000568477 IGF1RP08069 1367 aa24.91■■□□□ 1.58
CMTM3-215ENST00000568477 SHROOM2Q13796 1616 aa24.89■■□□□ 1.57
CMTM3-215ENST00000568477 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.88■■□□□ 1.57
CMTM3-215ENST00000568477 CUL7Q14999 1698 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-215ENST00000568477 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-215ENST00000568477 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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