Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HLA-DQB1P01920 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HLA-DQB1P01920 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HLA-DQB1P01920 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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