RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000241891.9

OPN4-201, Transcript of opsin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN4, Length 2,308 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4-201ENST00000241891 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.82■■■□□ 2.52
OPN4-201ENST00000241891 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN4-201ENST00000241891 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
OPN4-201ENST00000241891 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.46■■□□□ 1.67
OPN4-201ENST00000241891 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.37■■□□□ 1.65
OPN4-201ENST00000241891 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.35■■□□□ 1.65
OPN4-201ENST00000241891 ABCC9O60706 1549 aa25.07■■□□□ 1.6
OPN4-201ENST00000241891 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.06■■□□□ 1.6
OPN4-201ENST00000241891 NACADO15069 1562 aa24.85■■□□□ 1.57
OPN4-201ENST00000241891 SCRIBQ14160 1630 aa24.68■■□□□ 1.54
OPN4-201ENST00000241891 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.58■■□□□ 1.53
OPN4-201ENST00000241891 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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OPN4-201ENST00000241891 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
OPN4-201ENST00000241891 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
OPN4-201ENST00000241891 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.86■■□□□ 1.41
OPN4-201ENST00000241891 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.83■■□□□ 1.41
OPN4-201ENST00000241891 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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OPN4-201ENST00000241891 SMARCA4P51532 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN4-201ENST00000241891 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.59■■□□□ 1.37
OPN4-201ENST00000241891 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
OPN4-201ENST00000241891 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.34■■□□□ 1.33
OPN4-201ENST00000241891 SMARCA2P51531 1590 aa23.21■■□□□ 1.31
OPN4-201ENST00000241891 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
OPN4-201ENST00000241891 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.17■■□□□ 1.3
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OPN4-201ENST00000241891 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
OPN4-201ENST00000241891 TRIM41Q8WV44 630 aa23■■□□□ 1.27
OPN4-201ENST00000241891 HMGXB3Q12766 1538 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN4-201ENST00000241891 NCAPD3P42695 1498 aa22.91■■□□□ 1.26
OPN4-201ENST00000241891 ABCC8Q09428 1581 aa22.8■■□□□ 1.24
OPN4-201ENST00000241891 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.72■■□□□ 1.23
OPN4-201ENST00000241891 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN4-201ENST00000241891 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
OPN4-201ENST00000241891 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
OPN4-201ENST00000241891 SYNJ1O43426 1573 aa22.52■■□□□ 1.2
OPN4-201ENST00000241891 CFTRP13569 1480 aa22.5■■□□□ 1.19
OPN4-201ENST00000241891 PRDM2Q13029 1718 aa22.48■■□□□ 1.19
OPN4-201ENST00000241891 SOGA1O94964 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN4-201ENST00000241891 TOP2BQ02880 1626 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN4-201ENST00000241891 EEA1Q15075 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN4-201ENST00000241891 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN4-201ENST00000241891 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.35■■□□□ 1.17
OPN4-201ENST00000241891 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.34■■□□□ 1.17
OPN4-201ENST00000241891 HRCP23327 699 aa22.34■■□□□ 1.17
OPN4-201ENST00000241891 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
OPN4-201ENST00000241891 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.3■■□□□ 1.16
OPN4-201ENST00000241891 CUX1P39880 1505 aa22.27■■□□□ 1.16
OPN4-201ENST00000241891 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.24■■□□□ 1.15
OPN4-201ENST00000241891 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.12■■□□□ 1.13
OPN4-201ENST00000241891 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.12■■□□□ 1.13
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OPN4-201ENST00000241891 NESP48681 1621 aa22.11■■□□□ 1.13
OPN4-201ENST00000241891 GOLGA3Q08378 1498 aa22.1■■□□□ 1.13
OPN4-201ENST00000241891 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.08■■□□□ 1.13
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OPN4-201ENST00000241891 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.05■■□□□ 1.12
OPN4-201ENST00000241891 CEP162Q5TB80 1403 aa22■■□□□ 1.11
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OPN4-201ENST00000241891 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.98■■□□□ 1.11
OPN4-201ENST00000241891 KIF27Q86VH2 1401 aa21.98■■□□□ 1.11
OPN4-201ENST00000241891 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.98■■□□□ 1.11
OPN4-201ENST00000241891 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.94■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 TOPBP1Q92547 1522 aa21.92■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.92■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.91■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 PRXQ9BXM0 1461 aa21.91■■□□□ 1.1
OPN4-201ENST00000241891 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.89■■□□□ 1.09
OPN4-201ENST00000241891 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
OPN4-201ENST00000241891 CUX2O14529 1486 aa21.88■■□□□ 1.09
OPN4-201ENST00000241891 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
OPN4-201ENST00000241891 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
OPN4-201ENST00000241891 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN4-201ENST00000241891 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN4-201ENST00000241891 CLIP1P30622 1438 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN4-201ENST00000241891 IGF1RP08069 1367 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN4-201ENST00000241891 WDR97A6NE52 1622 aa21.74■■□□□ 1.07
OPN4-201ENST00000241891 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.66■■□□□ 1.06
OPN4-201ENST00000241891 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.63■■□□□ 1.05
OPN4-201ENST00000241891 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN4-201ENST00000241891 CUL7Q14999 1698 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN4-201ENST00000241891 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.61■■□□□ 1.05
OPN4-201ENST00000241891 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
OPN4-201ENST00000241891 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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OPN4-201ENST00000241891 ARAP1Q96P48 1450 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN4-201ENST00000241891 WDR62O43379 1518 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN4-201ENST00000241891 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN4-201ENST00000241891 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.47■■□□□ 1.03
OPN4-201ENST00000241891 ERCC6Q03468 1493 aa21.46■■□□□ 1.03
OPN4-201ENST00000241891 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.45■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 PBRM1Q86U86 1689 aa21.44■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 IFT140Q96RY7 1462 aa21.4■■□□□ 1.02
OPN4-201ENST00000241891 APLP2Q06481 763 aa21.38■■□□□ 1.01
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