Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms