Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGLP0DKB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGLP0DKB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGLP0DKB5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms