Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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