RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565700.1

ATP2C2-AS1-201, ATP2C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C2-AS1, Length 2,998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.12■■□□□ 1.93
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.64■■□□□ 1.37
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.04■■□□□ 1.28
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ABCC9O60706 1549 aa22.89■■□□□ 1.25
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 HRCP23327 699 aa22.55■■□□□ 1.2
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 MYT1Q01538 1121 aa22.47■■□□□ 1.19
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.32■■□□□ 1.16
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.05■■□□□ 1.12
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 NACADO15069 1562 aa22■■□□□ 1.11
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SCRIBQ14160 1630 aa21.88■■□□□ 1.09
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.86■■□□□ 1.09
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.72■■□□□ 1.07
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.62■■□□□ 1.05
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.34■■□□□ 1.01
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.19■□□□□ 0.98
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.03■□□□□ 0.96
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.91■□□□□ 0.94
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SMARCA4P51532 1647 aa20.9■□□□□ 0.94
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 WIZO95785 1651 aa20.9■□□□□ 0.94
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 NEUROD1Q13562 356 aa20.89■□□□□ 0.93
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BCL11AQ9H165 835 aa20.82■□□□□ 0.92
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.82■□□□□ 0.92
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.7■□□□□ 0.9
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.55■□□□□ 0.88
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SMARCA2P51531 1590 aa20.46■□□□□ 0.87
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.41■□□□□ 0.86
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.39■□□□□ 0.85
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 NCAPD3P42695 1498 aa20.32■□□□□ 0.84
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.32■□□□□ 0.84
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 HMGXB3Q12766 1538 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.23■□□□□ 0.83
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.07■□□□□ 0.8
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ABCC8Q09428 1581 aa20.04■□□□□ 0.8
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 NESP48681 1621 aa20■□□□□ 0.79
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 APLP2Q06481 763 aa19.91■□□□□ 0.78
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.91■□□□□ 0.78
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TRIM41Q8WV44 630 aa19.91■□□□□ 0.78
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CFTRP13569 1480 aa19.89■□□□□ 0.77
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PRDM2Q13029 1718 aa19.83■□□□□ 0.76
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.81■□□□□ 0.76
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.8■□□□□ 0.76
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SYNJ1O43426 1573 aa19.8■□□□□ 0.76
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.75
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.68■□□□□ 0.74
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.66■□□□□ 0.74
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CUX1P39880 1505 aa19.66■□□□□ 0.74
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.64■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TOP2BQ02880 1626 aa19.64■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.63■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 MIER1Q8N108 512 aa19.6■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 SOGA1O94964 1423 aa19.6■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.59■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.59■□□□□ 0.73
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ERCC6Q03468 1493 aa19.5■□□□□ 0.71
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.5■□□□□ 0.71
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.46■□□□□ 0.71
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.43■□□□□ 0.7
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TOPBP1Q92547 1522 aa19.43■□□□□ 0.7
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.43■□□□□ 0.7
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.35■□□□□ 0.69
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 EEA1Q15075 1411 aa19.31■□□□□ 0.68
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.28■□□□□ 0.68
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 CUX2O14529 1486 aa19.27■□□□□ 0.67
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 WDR97A6NE52 1622 aa19.24■□□□□ 0.67
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 KIF27Q86VH2 1401 aa19.22■□□□□ 0.67
ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 BCANQ96GW7 911 aa19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms