RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475371.5

PTPRG-AS1-205, PTPRG antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PTPRG-AS1, Length 733 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.38■■■■□ 3.73
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ABCC9O60706 1549 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.66■■■■□ 3.14
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.99■■■■□ 3.03
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.4■■■□□ 2.94
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.02■■■□□ 2.88
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NACADO15069 1562 aa32.99■■■□□ 2.87
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.9■■■□□ 2.86
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.62■■■□□ 2.81
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.46■■■□□ 2.79
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.03■■■□□ 2.72
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.99■■■□□ 2.71
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.7■■■□□ 2.67
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SCRIBQ14160 1630 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.58■■■□□ 2.65
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CUX2O14529 1486 aa30.82■■■□□ 2.53
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ERCC6Q03468 1493 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NCAPD3P42695 1498 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 HMGXB3Q12766 1538 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SMARCA2P51531 1590 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TRIM41Q8WV44 630 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SMARCA4P51532 1647 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 WDR62O43379 1518 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 OSCARQ8IYS5 282 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 WIZO95785 1651 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CFTRP13569 1480 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ARHGEF11O15085 1522 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 IFT140Q96RY7 1462 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PRDM2Q13029 1718 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TOPBP1Q92547 1522 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ARAP1Q96P48 1450 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 FBLN2P98095 1184 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CHD1O14646 1710 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ABCC8Q09428 1581 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SOGA1O94964 1423 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.14■■■□□ 2.09
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SYNJ1O43426 1573 aa28.06■■■□□ 2.08
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.97■■■□□ 2.07
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 GRIN2BQ13224 1484 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 WDR97A6NE52 1622 aa27.94■■■□□ 2.06
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.93■■■□□ 2.06
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SYNJ2O15056 1496 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CUX1P39880 1505 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PBRM1Q86U86 1689 aa27.74■■■□□ 2.03
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.7■■■□□ 2.03
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 GRIN2AQ12879 1464 aa27.57■■■□□ 2
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 CEP170Q5SW79 1584 aa27.56■■■□□ 2
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NUP160Q12769 1436 aa27.5■■□□□ 1.99
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ADAMTS12P58397 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 SHROOM2Q13796 1616 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 JPH4Q96JJ6 628 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
PTPRG-AS1-205ENST00000475371 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms