Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V9GY48 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V9GY48 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
V9GY48 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V9GY48 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms