RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340970.8

ANKRD33-202, Transcript of ankyrin repeat domain 33, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD33, Length 1,507 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD33-202ENST00000340970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.64■■■■□ 3.46
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ANKRD33-202ENST00000340970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD33-202ENST00000340970 SMARCA2P51531 1590 aa28.39■■■□□ 2.14
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ANKRD33-202ENST00000340970 NESP48681 1621 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD33-202ENST00000340970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
ANKRD33-202ENST00000340970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.76■■■□□ 2.03
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ANKRD33-202ENST00000340970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.55■■■□□ 2
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ANKRD33-202ENST00000340970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD33-202ENST00000340970 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD33-202ENST00000340970 WDR62O43379 1518 aa27.25■■□□□ 1.95
ANKRD33-202ENST00000340970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD33-202ENST00000340970 PRDM2Q13029 1718 aa27.13■■□□□ 1.93
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ANKRD33-202ENST00000340970 IFT140Q96RY7 1462 aa26.75■■□□□ 1.87
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ANKRD33-202ENST00000340970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD33-202ENST00000340970 SOGA1O94964 1423 aa26.48■■□□□ 1.83
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ANKRD33-202ENST00000340970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ANKRD33-202ENST00000340970 WDR97A6NE52 1622 aa26.32■■□□□ 1.8
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ANKRD33-202ENST00000340970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.2■■□□□ 1.78
ANKRD33-202ENST00000340970 SYNJ1O43426 1573 aa26.2■■□□□ 1.78
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ANKRD33-202ENST00000340970 PBRM1Q86U86 1689 aa26.14■■□□□ 1.77
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ANKRD33-202ENST00000340970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.13■■□□□ 1.77
ANKRD33-202ENST00000340970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.13■■□□□ 1.77
ANKRD33-202ENST00000340970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ANKRD33-202ENST00000340970 ARHGEF11O15085 1522 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD33-202ENST00000340970 SYNJ2O15056 1496 aa26.08■■□□□ 1.76
ANKRD33-202ENST00000340970 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.97■■□□□ 1.75
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ANKRD33-202ENST00000340970 CEP170Q5SW79 1584 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD33-202ENST00000340970 NUP160Q12769 1436 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD33-202ENST00000340970 KIF27Q86VH2 1401 aa25.73■■□□□ 1.71
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ANKRD33-202ENST00000340970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD33-202ENST00000340970 CUL7Q14999 1698 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD33-202ENST00000340970 SHROOM2Q13796 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD33-202ENST00000340970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD33-202ENST00000340970 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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