Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms