Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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