Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 UBE2J2-212ENST00000467339 515 ntTSL 27.85□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-206ENST00000491010 2308 ntTSL 57.67□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-209ENST00000531033 1809 ntTSL 24.63□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-203ENST00000407117 789 ntTSL 324■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-210ENST00000498417 2403 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-208ENST00000458278 623 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 ANKRD54-209ENST00000464849 456 ntTSL 310.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 PPP1R12C-208ENST00000592754 827 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 PPP1R12C-205ENST00000588277 419 ntTSL 315.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 PPP1R12C-207ENST00000591938 1262 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 PLXNB2-208ENST00000463165 3038 ntTSL 214.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 PLXNB2-209ENST00000479701 3504 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.21■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 NEURL4-209ENST00000573186 4431 ntTSL 512.2□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 43.6
SF3A3Q12874 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 216.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ELAC2-210ENST00000491478 758 ntTSL 513.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 43.5
SF3A3Q12874 ACADVL-228ENST00000582166 550 ntTSL 49.93□□□□□ -0.826e-11■■■■■ 43.4
SF3A3Q12874 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-24■■■■■ 43.4
SF3A3Q12874 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.657e-24■■■■■ 43.4
SF3A3Q12874 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 43.2
SF3A3Q12874 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 511.52□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 43.2
SF3A3Q12874 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.075e-25■■■■■ 43.1
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SF3A3Q12874 PMM2-211ENST00000566540 1557 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.075e-25■■■■■ 43.1
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SF3A3Q12874 PMM2-202ENST00000562025 569 ntTSL 413.98□□□□□ -0.175e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.275e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.875e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 PMM2-207ENST00000565221 793 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.985e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.015e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 PMM2-217ENST00000570076 1002 ntTSL 27.76□□□□□ -1.175e-25■■■■■ 43.1
SF3A3Q12874 EXOG-202ENST00000412107 1467 ntTSL 1 (best)25.46■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 ATXN7L2-204ENST00000463678 3022 ntTSL 525.18■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 HSDL1-206ENST00000567294 542 ntTSL 221.93■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 EXOG-205ENST00000436414 1679 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 VPS28-203ENST00000524521 564 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 PNPLA3-204ENST00000478713 730 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 EXOG-211ENST00000454803 1548 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 NFS1-207ENST00000421540 563 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 EXOG-207ENST00000443942 576 ntTSL 417.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 NFS1-209ENST00000456462 747 ntTSL 517.08■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 BRF1-209ENST00000547052 771 ntTSL 516.52■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 EXOG-206ENST00000438992 1440 ntTSL 216.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 43
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SF3A3Q12874 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 BRI3-202ENST00000456357 667 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 PHF8-207ENST00000415025 687 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 HSDL1-204ENST00000564998 459 ntTSL 415.24■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-209ENST00000511490 418 ntTSL 514.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-204ENST00000506186 580 ntTSL 214.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 NFS1-206ENST00000419569 551 ntTSL 314.23□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 TRAPPC12-203ENST00000411973 838 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 BRI3-203ENST00000473967 819 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 SNRPA1-213ENST00000560856 588 ntTSL 413.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 PHF8-210ENST00000437224 555 ntTSL 413.74□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 43
SF3A3Q12874 CCNG1-207ENST00000510097 564 ntTSL 413.72□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 43
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